Temporada 4

Apocalipsis se teletransporta en su nave hasta México en donde activa la primera pirámide y la envuelve con un campo de fuerza. Magneto y Los Acólitos se encuentran en la Esfinge tratando de averiguar más información sobre Apocalipsis.

Wanda estaba triste por la muerte de su padre y causa que el tren en el que viajaban se descarrilara y salvan a las demás personas, por lo que son bien recompensados y deciden causar más accidentes para salvar a la gente, pero causan un accidente que no pueden controlar y los X-Men tienen que ayudar a las personas.

Después de ser secuestrado por Omega Rojo, Wolverine se las arregla para escapar a un bosque cercano. Allí se encuentra con su clon, X-23, en una misión para destruir a la persona responsable de la creación de ella.

David, el hijo del Profesor Xavier ha sido aparentemente secuestrado. Xavier, Tormenta, Cíclope y Jean Grey van a buscarlo, pero resulta que David sufre de trastorno de personalidad múltiple.

Spyke hace su regreso, después de haberse convertido en el vigilante que protege a los Morlocks. Él no tiene miedo de ir en público con su mutación desfigurante, causa pánico en su entorno, sobre todo porque el repudio contra los mutantes va en aumento.

Gambito secuestra a Rogue, pero afirma que está tratando de ayudarla a olvidar lo que le hizo a Mystique.

Shadowcat conoce a Danielle Moonstar y rápidamente se hace amiga de ella. Sin embargo, ella se despierta a la mañana siguiente y se da cuenta que ella aparentemente soñó todo.

Apocalipsis absorbe la tecnología que había dentro de las pirámides, luego el Profesor Xavier se contacta con él y Apocalipsis muestra cuales son sus planes de convertir a todos los seres humanos con el gen X inactivo en mutantes.

Con el fin de evitar que toda la humanidad sea convertida en mutantes, los X-Men, La Hermandad, S.H.I.E.L.D., los Acólitos, Ángel, Spyke, Havok, y los Nuevos Mutantes unen sus fuerzas para salvar a la humanidad de las ambiciones de Apocalipsis.