Temporada 2

El Capitán K’nuckles accidentalmente atrapa Flapjack en un tarro cuando trata de obtener dulces de Isla Confitada. Esto lleva a Flapjack a emprender un largo viaje en un intento de regresar a su hogar, luego de ser arrastrado hacia el mar. Flapjack y el Capitán K’nuckles no pueden escapar de la casa del Dock Hag, después de un débil intento de destruir los boletos del muelle K’Nuckles, solo para descubrir que el Dock Hag está enamorado del pirata.

Después de una discusión sobre la puerta de Bubbie, Flapjack y el Capitán K’nuckles deciden intercambiar vidas por el día, para ver quién es más difícil. Para K’nuckles, que está vestido como Flapjack, terminó enmarcando el verdadero Flapjack con hechos nefastos. Flapjack y el Capitán K’nuckles acogen a un rico extraño y esperan sacar provecho de su bondad para que puedan pagar sus boletos de muelle y poder regresar al Puerto.

Cuando Flapjack y el Capitán K’nuckles quedan atrapados en la luna después de ser perseguidos por Ocho-Armed Willy, descubren que podría llevarlos a la largamente codiciada Isla Candied. El Capitán K’nuckles evita ser contado en un censo hecho por Flapjack, debido a que está avergonzado de su incapacidad para contar hasta el número cuatro, lo que ayuda a salvar el día.

Cuando Flapjack ayuda al Capitán K’nuckles a buscar su sombrero perdido en una isla llena de chimpancés, terminan encontrándose con un investigador que vive entre los animales. Con su ayuda, deben llegar al “lugar de encuentro secreto”. Flapjack intenta romper al Capitán K’nuckles de su adicción a los dulces después de que desarrolla la pudrición del caramelo. Después de varios intentos para mantenerlo alejado de los dulces, Flapjack y Bubbie envían a K’nuckles al mar en una balsa.

K’nuckles anhela entrar al área VIP del Candy Barrel. Flapjack puede tener un problema para abrazarse demasiado.

El Capitán K’nuckles se siente infeliz con su propia imagen corporal, y su problema se agrava cuando aparece un aventurero más hermoso y más rudo que comienza a atraer a Flapjack lejos del Capitán K’nuckles. El Capitán K’nuckles se ha cansado de que Bubbie termine sus cuentos imaginarios con un final feliz para ellos, así que el Capitán K’nuckles decide llevar a Flapjack en un viaje para encontrar una historia con un final infeliz. Cuando eso falla, el Capitán K’nuckles decide inventarse una historia final infeliz por sí mismo. Pero el Capitán K’nuckles puede descubrir que está mordiendo más de lo que puede masticar.

Bubbie está celosa del nuevo barco de K’nuckles luego de que Flapjack y K’nuckles lo compraran por solo un penique. Bubbie se pone celosa porque Flapjack y K’nuckles lo usarían en lugar de cabalgar sobre ella. Desafortunadamente, el Barón Berserker anda suelto. Flapjack vigila a Candy Wife mientras Peppermint Larry está fuera de la ciudad. Desafortunadamente, el Capitán K’nuckles comienza a jugar bromas a Candy Wife, hasta que le dice a Flapjack que se casará con Candy Wife.

Cansado de que Bubbie siempre cuestione su autoridad, el Capitán K’nuckles decide ubicar el barco donde están guardados los papeles de su Capitán y se los muestra a Bubbie para que finalmente sepa que el Capitán K’nuckles es real. Después de que K’nuckles le apuesta a Peppermint Larry que podría comerse un tarro entero de dulces, y gana, uno de los clientes apuesta a Flapjack después de que se cansa de escucharlo decir “aventura” cuando entra en el Candy Barrel.

Cuando Bubbie tiene un dolor de estómago, Flapjack debe hacer el peligroso viaje al estómago para arreglarla. Cuidado con la tienda, no mire en el cajón: el Dr. Barber deja Flapjack y K’nuckles para cuidar su tienda, con una regla muy importante.

K’nuckles y Flapjack visitan un club de narración de cuentos, donde K’nuckles descubre que sus propias historias pueden estar desactualizadas. Flapjack engaña a K’nuckles para que crea que hay un monstruo marino atacando a Stormalong.

Flapjack es invitado a una fiesta de cumpleaños, pero se siente avergonzado cuando los otros niños perciben a K’nuckles y Bubbie como “raros”, incluido él mismo. Flapjack pretende ser un perro para Lady Nicklebottoms, mientras que K’nuckles encuentra el perro real. Sin embargo, después de que Flapjack y Lady Nicklebottom se lo pasaron tan bien juntos, Charles (el mayordomo de Nicklebottoms) se pone celoso e intenta lanzar Flapjack al mar. Mientras tanto, K’nuckles experimenta las alegrías de tener un perro.

En el primer especial navideño de media hora de duración, Flapjack celebra el “Día de las mareas bajas” y espera sus regalos de Poseidón, mientras que K’nuckles trata de encontrar un escondite para no ser saqueado por los tritones por ser un niño malo.

Bubbie bota a K’nuckles, y Flapjack intenta reconciliarlos. Cuando el gordo policía crea la primera bicicleta en Stormalong, Flapjack y K’nuckles encuentran difícil salirse con la suya, especialmente cuando el alguacil comienza a abusar de su autoridad y los castiga severamente por ofensivas menores.

Bubbie (y eventualmente K’nuckles) intenta rescatar a Flapjack de una anciana que piensa que es un niño desaparecido. Sally Syrup regresa a Stormalong, para su disgusto y Flapjack debe convencerla de que Stormalong no es tan malo.

Cuando K’nuckles gana un concurso por ser el hombre más perezoso de Stormalong, el dueño original del título se venga secuestrando a Flapjack. Flapjack y K’nuckles intentan hacerse amigos de dos ancianos que poseen un cofre del tesoro de la isla de Candied.

K’nuckles es intimidado por un grupo de marineros en el Candy Barrel y Flapjack trata de convencerlo de que no es un cobarde. K’nuckles y Flapjack se quedan varados en una isla extraña y no pueden encontrar el océano.

K’nuckles y Peppermint Larry hacen una apuesta, y el ganador recibe un beso de Candy Wife. El deseo de K’nuckles de que todos en Stormalong desaparecieran se hace realidad, pero pronto comienza a arrepentirse de haber hecho su deseo.

Flapjack ingresa a la armada, solo para descubrir que no es emocionante como él creía. K’nuckles se infesta con termitas.

Flapjack se molesta cuando su imagen aparece en el periódico. Flapjack intenta ayudar a Lolly Poopdeck a obtener respeto.

Hay consecuencias nefastas cuando Flapjack se hace pasar por un marinero.