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Yato es un dios menor que sueña con tener una gran cantidad de seguidores que lo adoren y recen plegarias por él. Desafortunadamente, su sueño está lejos de hacerse realidad, debido a que no tiene ni siquiera un solo santuario dedicado a su persona. Para empeorar las cosas, la única socia que tenía para ayudar a resolver los problemas de la gente acaba de renunciar. Su divina suerte sólo podría cambiar cuando conoció a Hiyori Iki, una estudiante de secundaria. Tras verse involucrada en un accidente, Hiyori se convierte en una han'yō o semi-fantasma. Metida en un lío bastante grande, la joven decide quedarse con Yato hasta que consiga recuperar su antiguo estado como humana. Junto a Hiyori y su nuevo shinki (tesoro sagrado o regalía) Yukine, Yato hará todo lo que pueda para ganar fama, reconocimiento y sólo tal vez, una capilla dedicada a él también.
Yato es un Dios callejero desempleado que lucha contra los fantasmas y resuelve los problemas de los humanos por solo 5 yenes. Pero poco sabe que una búsqueda de un gato perdido está a punto de llevar a un encuentro fatídico...
Enojado porque Yato aún no ha encontrado una manera de curarla, Hiyori toma el asunto en sus propias manos. Ella se apresura a encontrar una nueva regalía para Yato, ¡pero se encuentra con el desastre!
Yukine aprende que vivir con un dios no es todo lo que está roto, ¡pero las cosas comienzan a cambiar cuando un cliente inesperado contrata a Yato para un trabajo!
Yato presenta a Yukine y Hiyori a uno de los siete dioses de la fortuna ... ¡Excepto que este dios no se parece en nada a lo que imaginaron!
Yato le enseña a Yukine una nueva técnica para evitar Phantoms ... ¡Y no hace mucho tiempo hasta que esta habilidad se ponga a prueba! Para empeorar las cosas, Yukine también debe lidiar con los pensamientos y sentimientos traviesos que tiene para Hiyori...
Yato y Yukine son de repente atacados por Bishamon, una diosa de la guerra de la guerra. Mientras Yato intenta lidiar con la situación en un estado herido, Hiyori busca ayuda de otro Dios...
Bishamon y otros dioses deben exterminar los fantasmas que han salido de la ventilación recién inaugurada. Sin embargo, Yukine y Yato todavía están en términos hostiles, un hecho que la misteriosa Nora usa para su ventaja.
A pesar de su mal estado, Yato es contratado para ayudar a un estudiante con un problema de acoso escolar. Pero las cosas dan un giro drástico cuando tanto el estudiante como la Yukine se enfrentan a la realidad, con la realidad de sus situaciones.
Con Yato al borde de la muerte, Hiyori y sus amigos deciden celebrar un ritual de purificación peligroso que requiere ayuda externa. ¿Pero quién arriesgaría voluntariamente su vida por este Dios desconocido?
Hiyori suena en el Año Nuevo visitando un santuario cercano. Nora y un siniestro Dios de la calamidad llamado Rabo tienen otros planes para ella, aunque...
Hiyori pierde misteriosamente todo el recuerdo de Yato pero nadie más. Mientras Yato lucha por ayudarla a recordar, Nora y Rabo continúan con su esquema.
Yato y Yukine se enfrentan a Rabo y Nora en una batalla final.