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El Gran Anciano ha designado un sucesor. Mientras tanto, en Namekusei, Freezer ruega misericordia a Son Goku. Namekusei va a estallar en cualquier instante.
Con Freezer derrotado, es el momento de usar las Esferas del Dragón de Namekusei, que pueden resucitar a una persona más de una vez.
Ha pasado un año y todavía Goku no ha regresado a la Tierra. Sin embargo, se revela que Freezer logró sobrevivir a su batalla con el Super Saiyajin, se ha reconstruido en un cyborg por su padre, el Rey Cold, y se dirige hacia la Tierra, con la intención de vengarse de Goku. El resto de los guerreros Z se reúnen para defender la Tierra de Freezer, a pesar de saber que las probabilidades están en contra de ellos. Sin embargo, tan pronto como Freezer, el Rey Cold, y su ejército de soldados llegan a la Tierra, se encuentran con un joven misterioso que posee una espada, que afirma que ha venido a matarlos.
Un misterioso adolescente ataca a los soldados de Freezer y avanza hacia el tirano, transformándose en un Súper Saiyajin.
Goku llega a la Tierra justo en el lugar y en el momento en que había predicho el misterioso joven, quien, a solas con él, le confiesa llamarse Trunks, que viene del futuro y que, dentro de tres años, habrá un ataque devastador protagonizado por unos androides diabólicos creados por el doctor Gero. Para salvar la vida y el planeta Tierra, tienen tres años para entrenar muy duro.
Después de explicar cómo sobrevivió a la explosión de Namek aterrizando en el planeta Yardrat, Goku, hace una demostración de su nueva técnica; el Shunkanido, que le permite teletransportarse. Acto seguido, comienza el entrenamiento de tres años para hacer frente a los misteriosos androides que llegarán en breve a la Tierra.
Después de tres años de entrenamiento intenso, por fin llega el día fatídico en el que aparecen los misteriosos androides. El primero en caer será en Yamcha, que descubre que son capaces de absorber la energía de sus adversarios con las palmas de las manos. Después de dirigirse lejos de la ciudad para evitar muertes innecesarias, comienza la verdadera batalla.
Después de descubrir que el doctor Gero lleva años recopilando información sobre Son Goku, comienza la batalla contra el Androide Nº19, mientras que el resto de guerreros son incapaces de luchar. Todo va bien, hasta que Goku se da cuenta de que su corazón empieza a debilitarse y que el Nº19 le está absorbiendo toda la energía.
Justo en el momento en que Goku ya no tiene nada que hacer contra el temible Nº19, irrumpe en escena Vegeta con una demostración de sus flamantes poderes de Súper Saiyan y con la intención de reducir al androide a chatarra. Mientras, el Nº20 huye y se esconde en las colinas. Si los planes de Gero siguen adelante, el mundo puede ser una ruina; no lo pueden permitir.
Mientras los Guerreros Z se separan para buscar al androide Número 20, Trunks regresa del futuro para descubrir que los androides no son los mismos que los de su línea temporal.
El androide Número 20 ha desaparecido. Los Guerreros Z deciden buscar el laboratorio del doctor Gero y destruir a los androides. Vegeta, sin embargo, tiene otros planes.
El Dr. Gero llega a su laboratorio y despierta a los Androides Número 17 y Número 18. Mientras los Guerreros Z aguardan, los recién despertados descubren que también existe el Androide Número 16.
Vegeta ha desafiado a combatir a la Androide Número 18, mientras Número 17 pelea contra los demás.
Trunks explica que los androides en su mundo eran diferentes, y los de ahora son mucho más fuertes. Pikkoro decide hablar con Kamisama para ser más fuerte.
Bulma recibe una llamada telefónica de uno de los trabajadores de su compañía: ha aparecido la misma máquina del tiempo que trajo a Trunks.
Trunks, Gohan y Bulma están investigando la otra máquina del tiempo. Mientras, en una ciudad, todas las personas han desaparecido, dejando atrás sus ropas.
Los guerreros están confundidos al percibir simultáneamente los Ki de Freezer, Vegeta y Goku, quien sigue convaleciente. Pikkoro empieza a luchar contra el nuevo enemigo, pero éste conoce unas técnicas muy particulares.
Cell explica que él mismo fue creado a partir de las células de los más grandes guerreros, y que puede alcanzar su forma completa gracias a los Androides Número 17 y Número 18.
Krilin y Trunks se separan de Pikkoro y Tenshinhan y visitan el sótano del laboratorio del Dr. Gero, donde destruyen al embrión de Cell. Justo entonces, también encuentran los planos de Número 17 y deciden llevárselos a Bulma.
Una vez recuperado, Goku decide llevar a Gohan y a los otros a la Cámara del Tiempo, donde pueden someterse a un año de entrenamiento en un solo día. Mientras, los androides siguen el rastro de Goku hasta la Kame House.
Pikkoro y el Número 17 luchan ferozmente, pero Cell detecta el Ki y descubre su paradero. Al mismo tiempo, en la Kame House reciben la noticia de que Bulma ha completado un control remoto que puede apagar a los androides.
Ante Pikkoro y Número 17 aparece Cell, quien se ha vuelto mucho más poderoso al absorber la bioenergía de innumerables personas. Pikkoro intenta atacar a Cell para evitar que absorba a los androides, pero se encuentra indefenso ante él.
Después de derrotar a Pikkoro, Cell comienza a atacar al Número 17, pero cuando trata de absorberlo, el Número 16 acude en su ayuda. Número 16 consigue detener durante un tiempo a Cell, pero el monstruo aprovecha un descuido para absorber al Número 17.
Tenshinhan sigue disparando su Shin Kikohu contra Cell para dar la oportunidad de escapar a la Número 18, pero al final se queda sin energía. Al mismo tiempo, Vegeta y Trunks acaban su entrenamiento y salen de la Cámara del Tiempo.
Mientras Goku y Gohan entran en la Cámara del Tiempo, Vegeta y Trunks aparecen ante Cell, quien está destruyendo las islas en busca de la Número 18. Vegeta se muestra confiado y supera a Cell con su asombroso poder.