Temporada 3

La exnovia de Guepardo, una mujer japonesa llamada Yuriko, atrae a Guepardo a los túneles de los Morlocks con Gambito y Jubilo siguiendo a Guepardo.

El descubrimiento extraterrestre de Yuriko, un buque shi'ar, resulta ser una celda de prisión que contiene a un prisionero voraz, el Roba Espíritus, que absorbe los espíritus del Jubilo, los Segadores, los Morlocks y, más tarde, Yuriko.

Un emisario de la raza alienígena Shi'ar, Erik el Rojo se hace cargo de la estación espacial Eagle One. Obligado por visiones misteriosas, el profesor Xavier envía a los X-Men para ocupar los lugares de la tripulación de astronautas.

El transbordador espacial aterriza en la bahía de Jamaica. Aunque los otros X-Men están ilesos, el destino de Jean Grey es desconocido, hasta que vuela en el aire, mostrando poderes y un nuevo disfraz que nunca ha usado antes, y se proclama a sí misma "Fenix".

Los X-Men y Banshee van a salvar a Lilandra de Juggernaut y Black Tom Cassidy Lilandra revela que ella llegó a la tierra buscando ayuda para proteger a El Cristal M'Kraan de su tirano hermano D'Ken.

Phoenix transporta a la mayoría de los X-Men a la nave de Lilandra, donde ha escondido el Cristal M'Kraan. Un grupo de piratas espaciales llamados Starjammers atacan y roban el Cristal M'Kraan de los X-Men.

D'Ken es arrastrado hacia el Cristal y se convierte en uno con el universo en su interior. Esto obliga a los X-Men y la Guardia Imperial a unirse para combatir desesperadamente al dictador aparentemente omnipotente.

Sauron secuestra a Tormenta en la Tierra Salvaje para alimentarse de su energía mutante. Wolverine, Bestia, Titaniay Jubilo van tras él a la Tierra Salvaje.

Garokk se fusiona con el volcán de la isla y la creciente fuerza planetaria debajo de él.

Arcángel se ha obsesionado con destruir a Apocalipsis, a quien culpa por arruinar su vida.

El Fénix continúa habitando el cuerpo de Jean. Jean está empezando a perder el control, y el Fénix comienza a tomar descaradamente a voluntad.

Mientras el Profesor X y Emma Frost luchan por el control psíquico de Jean, los miembros del Círculo Interior se pelean por cómo deshacerse de sus prisioneros, los X-Men. Mientras tanto, el Fénix comienza a crecer en su sed de nuevas sensaciones malignas y enciende tanto al Círculo Interno como a los X-Men.

La transformación del Fénix oscuro está completa y ella comienza su alboroto. Cuando los X-Men se enfrentan al Fenix y le piden que entregue el cuerpo de Jean.

En la corte de Shi'ar, Lilandra revela la vasta destrucción del sistema solar D'Bari del Fenix Oscuro y declaró que se ha transformado en el Destructor de la leyenda y debe morir.

El antiguo X-Man, Bobby "Iceman" Drake está atrapado entrando a una instalación gubernamental de alto secreto.

Ciclope descubre que Corsario es su padre. Corsario está huyendo de las autoridades de Shi'Ar, quienes exigen que los Cíclopes se los entreguen.

La vida de Juggernaut corre peligro cuando alguien descubre el Ruby de Cyttorak y reclama los poderes de Juggernaut por sí mismo.

Gambito, Titania y Guepardo hacen un viaje de esquí en Alemania. Mientras que Gambito y Titania parecen estar disfrutando mucho de la compañía y el tiempo que pasamos juntos, Guepardo está inquieto y anhela algo de acción.

Una fotografía enigmática desata un torrente de recuerdos enloquecedores y dolorosos en Guepardo que amenazan con volverlo loco. Para evitar que su mente se desgarre, Guepardo y Bestia viajan a la única ubicación que puede contener las respuestas a su pasado oculto; las ruinas del laboratorio de alto secreto Arma X.