Un asteroide se dirige hacia la Tierra y la ISDA crea la 'Dragonaut' tras encontrar un huevo de dragón bajo el océano. Jin Kamishina, un solitario joven de 18 años que perdió a su familia en un accidente de transbordador, se ve envuelto en los misterios de los dragones y se convierte en el piloto elegido del Dragonaut.