Temporada 1

El jefe de Roberta, Diego Lovelace, fue asesinado, aparentemente como parte de una guerra entre la CIA y la NSA. Ella jura castigar a los responsables sin importar lo que cueste. Fabiola (su suplente), Black Lagoon y el Sr. Chang se ven envueltos en el conflicto.

Rock acepta la oferta de encontrar a Roberta antes de que ella declare la guerra a las tropas estadounidenses. Intenta resolver el enigma del paradero de Roberta recopilando información parcial de todas partes. Al mismo tiempo, el City Ring (la tríada de Hong Kong, el Hotel Moscú, la mafia italiana y el cártel colombiano) se reúne para decidir qué hacer a continuación. La decisión se mantiene en secreto, pero vemos que el Sr. Chang acude a la Iglesia de la Violencia y un miembro de la CIA (Eda) le informa sobre los movimientos recientes de los comandos de la NSA (compañías Alfa, Bravo y Charlie).

Revy busca información sobre la ubicación de Roberta y reúne un equipo formado por Rock, García, Fabiola, Shenhua, Sawyer y Lotton. Al llegar, se encuentran con un feroz conflicto en el que están involucrados Roberta, el ejército estadounidense y otros. García, separado del grupo, es testigo de las brutales habilidades de combate de Roberta. Un soldado, en lugar de matarla, intenta reclutarla de nuevo para las FARC. Roberta finge excitación y hiere al soldado. Cuando García interviene, Roberta le apunta con un arma, creyendo que es una alucinación.

Después de que García sea rescatado por soldados estadounidenses, Roberta derrota a Shenhua, Sawyer y Lotton utilizando fuerza no letal. Fabiola se enfrenta a Roberta y reconoce su locura. García, ahora consciente, apunta con un arma al comandante Shane, quien accede a la búsqueda de venganza de García. Roberta ataca, pero es repelida con la ayuda del Hotel Moscú. Mientras tanto, Rock organiza que la Compañía Lagoon ayude a los estadounidenses. Revy y Shenhua quieren atacar a los estadounidenses, pero Hotel Moscow las detiene. García entrega a los estadounidenses un mapa del sobre de Rock y se dirigen a la costa. Roberta ataca de nuevo, pero Hotel Moscow interviene. El Black Lagoon zarpa hacia el río Mekong con García, Fabiola, los estadounidenses y la Compañía Lagoon, mientras Eda manipula a Roberta para que suba a un avión.

Tras las conversaciones entre García y Rock, así como entre Fabiola y Revy, García decide seguir el plan de Rock. Revy sufre flashbacks de su traumática experiencia al ser violada por policías en la cárcel. El Black Lagoon llega al Triángulo Dorado y los estadounidenses se embarcan en su misión. En la selva, son atacados por Roberta con un mosquete antiguo, que mata a varios enemigos, pero ella misma resulta gravemente herida. García, Fabiola y la comandante Shane se enfrentan a Roberta. García El enfrentamiento termina con García besando a Roberta. Mientras tanto, Rock comparte sus motivos con Revy y predice la victoria sobre Chang. Mientras los heridos son trasladados al Black Lagoon, Fabiola descarga su ira disparando una bala de fogueo a Rock. Meses más tarde, Rock se da cuenta de que Roanapur sigue igual. Roberta, que ahora ha perdido un brazo y una pierna, vive en la mansión de García y conoce a la familia de su antigua víctima.