Temporada 5

El asesino a sueldo Eddie Lorca hace todo de manera aleatoria, lo que lo hace imposible de anticipar. El IMF debe descubrir quién es su jefe, Scorpio, y lo único que saben es que Lorca está llegando a la ciudad para una misión, pero no saben contra quién va a enfrentarse.

El IMF debe desmantelar una red de contrabando de drogas. Bracken recibe sus drogas de México, cortesía de Diego Maximillian, quien las obtiene legalmente de C.W. Cameron. El IMF debe vincular a Cameron con Bracken.

En el Medio Oriente, Willy y Barney se infiltran en una planta química para obtener acceso al Dehominant-B, un gas letal de acción rápida. Barney queda expuesto al Dehominant-A mientras intenta llegar a la computadora y queda paralizado. Willy escapa y Barney es capturado. Barney es interrogado y solo tiene cuatro horas de vida. El equipo descubre que el Dr. Jerry Carlin, un desertor, es la única otra persona con las habilidades necesarias para acceder a la computadora.

Cuando Jim regresa a su ciudad natal, Norville, para donar propiedades familiares a la comunidad, descubre que está siendo azotada por un asesino en serie. Jim secretamente trae a Barney para ayudar en la investigación. Un veterano perturbado de Vietnam es el principal sospechoso del asesinato, pero Jim y Barney descubren que es inocente, lo sacan de la cárcel un paso adelante de una multitud enfurecida, y luego llaman al resto del equipo IMF para encontrar al verdadero asesino.

El presidente Rojas planea dar un discurso ante el Congreso de los EE. UU., mientras que su jefe de Seguridad Interna, Ferrar, planea un golpe de estado y envía a un asesino conocido solo como Plato (y conocido solo por Ferrar) para matar al presidente antes de que dé su discurso. El IMF debe averiguar quién es Plato y frustrar el asesinato.

Un agente comunista, Karl Maur, ve a Paris de vacaciones, lo noquea y lo entrega al Dr. Tabor, quien es un especialista en cerebros y experto en control mental. Incapaz de romper a Paris, Tabor borra la memoria de Paris y usa un electrodo implantado para programarlo para que ataque a Jim.

Toshio Masaki, un poderoso industrialista antiamericano, mata a su hermana y pone la culpa a su esposo, un empresario estadounidense llamado Harry Kellem, para desacreditar a América y al Consejo Económico.

Anna Kerkoska planea desertar con una lista de agentes estadounidenses que su padre, el fallecido Premier, le dio. Su hermano Alexi también planea desertar, pero en realidad es un plan para apoderarse de la lista, entregársela al jefe de policía Petrovitch y traicionar a su hermana.

El equipo debe robar un láser de cohete y sacar del país al Padre Bernard junto con su lista de operativos occidentales. Bernard pone al equipo en contacto con Wittstock, quien les consigue el láser. Wittstock es asesinado después de entregar el arma y el Coronel de Policía Eckert cierra el país para capturar al equipo.

Una misión para rescatar a un disidente sudafricano sale mal cuando Doug y su asistente blanco sacan al hombre del hospital, pero el asistente es disparado en la pierna. Separado del resto del equipo IMF, el asistente se tambalea hasta una tienda donde una niña sorda descubre que el hombre es Barney con una máscara.

El IMF debe rescatar a tres científicos en un país dictatorial y destruir sus notas. Rescatan a dos, pero el tercero, Khora, se niega a irse y es ejecutado. Jim y Dana se encuentran con su hijo Alex (un líder rebelde) para conseguir sus notas.

Albert Zembra, jefe de la rama mediterránea del Sindicato, está muriendo de cáncer y planea pasar su lista de plantaciones de opio a su sucesor elegido. Tiene la intención de entregar el poder a Carlos Empori, prometido de su nieta.

Después de completar una misión, Paris está encubierto como un empresario estadounidense y aún con su disfraz cuando es secuestrado por revolucionarios latinoamericanos liderados por el terrorista Robert Siomney. Ellos exigen la liberación de tres prisioneros a cambio de la vida de Paris.

Phelps debe detener a Charles Peck de usar la violencia, creada por el provocador profesional Billy Walsh, para elevar a su títere, el alcalde Steven Tallman, a la gobernación.

Larry Collier, editor de un periódico y hermano de Barney, es asesinado mientras intentaba establecer un vínculo entre el corrupto jefe de policía Abbott y Corley, el líder de una mafia en un gueto que oculta sus actividades ilegales con una empresa fachada de seguros. Barney, quien tiene un pasado como contable corrupto, se acerca a Corley al rescatar a su secretaria Millie. Corley lo contrata cuando se entera de su "pasado".

James Read, un agente enemigo, se hace pasar por analista para acceder a un sistema de guía de misiles ultrasecreto de EE. UU. que está siendo probado y robar los planos. El IMF debe hacer que tome planos falsos y pase sin saberlo la información incorrecta a sus superiores.

Una potencia enemiga ha lanzado un satélite que contiene una bomba termonuclear y el IMF debe destruirlo. El centro de control en una isla en el Mar Adriático está rodeado por un campo de minas impenetrable diseñado por un desertor estadounidense, Norris.

Gregory Tolan lidera una célula subterránea especializada en robos de bancos, con el dinero destinado a financiar una revolución estadounidense. Su misterioso patrocinador es Jonathan Brace, quien dirige otras células similares en todo EE. UU. El IMF debe descubrir la identidad de Brace y detenerlo.

En San Pascal, el primer ministro Miguel Fuego y su sobrino Ramone han firmado un tratado secreto de armas con una potencia comunista para permitir la instalación de misiles nucleares dirigidos a los EE. UU. en su país. El IMF debe exponer el tratado antes de que los misiles sean instalados.

John Darcy, nombre en clave 'Kitara', lidera un movimiento de liberación en el país africano de Bocamo y ha sido capturado inadvertidamente por el despiadado coronel Kohler. Kohler planea torturar a Kitara, quien, si confiesa su verdadera identidad, provocará la destrucción de todo el movimiento. Kohler está tras un camión lleno de lingotes de oro del gobierno que Kitara robó.

Howard Bainbridge, un experto en guerra química que desertó hacia el Este, fue contaminado por sus propios experimentos y luego regresó a los EE. UU. y a la mansión familiar, donde su padre (un paranoico archiconservador) mandó matarlo y enterró el cuerpo. Dado que Howard destruyó los registros antes de desertar, el IMF debe recuperar el cuerpo para obtener una muestra de los productos químicos.

Alexander Vanin, arrestado y condenado por espionaje, ocultó una lista de agentes que operan en los EE. UU. Su controlador, Mishenko de la EEPR, ha recibido la orden de conseguir la lista, pero Vanin se niega a entregarla porque, si lo hiciera, Mishenko lo abandonaría. El IMF debe conseguir la lista.

Armand Anderssarian es un traficante de armas ilegal que está a punto de completar un acuerdo multimillonario vendiendo armas a grupos guerrilleros en todo el mundo; el IMF debe detenerlo.